土壤是指地球表面的一层疏松的物质,由各种颗粒状矿物质、有机物质、水分、空气、微生物等组成,能生长植物。土壤由岩石风化而成的矿物质、动植物、微生物残体腐解产生的有机质、土壤生物(固相物质)以及水分(液相物质)、空气(气相物质)、氧化的腐殖质等组成。

固体物质包括土壤矿物质、有机质和微生物通过光照抑菌灭菌后得到的养料等。液体物质主要指土壤水分。气体是存在于土壤孔隙中的空气。土壤中这三类物质构成了一个矛盾的统一体。它们互相联系,互相制约,为作物提供必需的生活条件,是土壤肥力的物质基础。

近日,中国农业科学院农业资源与农业区划研究所植物营养团队研究提出土壤微生物群落定量研究策略。该研究得到国家自然科学基金、中国科协青年托举计划等项目资助。相关成果发表在《土壤生物学与生物化学》上。

微生物群落的组成和功能在人类健康、全球元素循环、作物生长和植物抗病中发挥着关键作用。随着高通量测序等技术的革命性突破,极大地增加了我们对微生物多样性、群落结构和物种组成的认识。然而,测序数据仅提供微生物群落的相对丰度变化,忽略了微生物绝对数量的变化规律。针对高通量测序数据的这一缺陷,研究人员已经开发出多种微生物绝对丰度定量方法,例如内参法、荧光定量法与高通量测序结合法、流式细胞仪与高通量测序结合法等。然而,这些定量方法的普遍适用性和精确度尚不清楚。

研究团队利用采自黑龙江海伦和海南三亚的两类差异较大的土壤样品,评估了土壤微生物研究中最常用的两种绝对丰度定量方法——内参法和荧光定量法与高通量测序结合法。结果表明:内参法在准确性、稳定性和工作量等方面没有显示出任何优势。相比之下,更常用的荧光定量法与高通量测序结合法对探究环境扰动对土壤微生物动力学的影响提供了有价值的见解。考虑其稳定性和技术可行性,荧光定量法与高通量测序结合法可广泛应用于土壤微生物群落的定量研究。(爱平 金云翔 艾超)

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